| 年代 | トピックス |
|---|---|
| 1999 | 1月25日 株式会社横浜フリエスポーツクラブ登記完了
3月5日JFL準会員加盟正式承認 |
| 2000 | 4月16日2000年度JFL開幕 正会員としてリーグ戦を戦う
11月5日JFL後期優勝 年間総合優勝 |
| 2001 | 3月10日2001Jリーグ開幕 横浜fCのJ2リーグ初陣
3月17日横浜FCのJリーグ初勝利（対ベガルタ仙台戦） |
| 2002 | 11月17日2002年J2リーグ全日程終了 J2リーグ12位
12月2日2003シーズン監督にリトバルスキー就任が決定 |
| 2003 | 2月1日城彰二の加入を発表
12月25日神野卓哉現役引退 強化担当に就任 |
| 2004 | 11月23日眞中幹夫現役引退を発表
12月16日2005シーズンの監督に足達勇輔の就任が決定 |
| 2005 | 7月19日三浦知良をヴィッセル神戸より獲得
8月16日山口素弘をアルビレックス新潟より期限付きにて獲得 |
| 2006 | 11月23日城彰二が現役引退を発表
11月27日2006シーズンJ2リーグ優勝が決定 J1昇格内定 |
| 2007 | 3月10日J1リーグ横浜ダービーの再開（対 横浜F・マリノス）1対0で横浜FCの勝利
8月4日三浦淳宏をヴィッセル神戸より獲得 |
| 2008 | 1月13日奥大介が現役引退を発表
10月25日J2第41節vs愛媛FC戦にて三浦知良J1/J2通算150ゴール達成 |
| 2009 | 1月18日横浜FCオフィシャルマスコット「フリ丸」DEBUT!!
12月6日2010シーズン監督に岸野靖之の就任が決定 |
| 2010 | 6月26日練習場及びクラブ事務所を横浜市保土ケ谷区へ移転
12月5日早川知伸 現役引退を発表 |
| 2011 | 3月11日東日本大震災が発生 リーグ戦一時中断
8月5日横浜FCユースから小野瀬康介が初の2種登録 |
| 2012 | 3月21日山口素弘監督就任
11月11日J1プレーオフ進出 |
| 2013 | 横浜FCユースよりMF石井圭太GK高丘陽平2名がトップチーム昇格内定
12月25日横浜FC創設15周年を迎える |
| 2014 | 11月22日奥寺康彦会長がAFC殿堂入り
12月3日2015シーズンの新監督にミロシュルスの就任を発表 |
| 2015 | 9月15日中田仁司強化育成テクニカルダイレクター監督就任
12月1日ミロシュルス監督再契約 |
| 2016 | 3月4日イバ加入
9月21日横浜FCユースより山本凌太朗トップチーム昇格内定 |
| 2017 | 10月24日タヴァレス監督就任
11月イバJ2リーグ得点王 |
| 2018 | 3月 斉藤光毅選手 横浜FCユースよりプロ契約選手として加入
5月 8年ぶりにJ1参入プレーオフに進出 |
| 2019 | 5月 下平隆宏ヘッドコーチが監督に就任
7月 中村俊輔選手・皆川佑介選手 加入 11月 最終節 愛媛ＦＣ戦を2-0で勝利し13年ぶり悲願のＪ１昇格が決定 |
| 2020 | 3月 新型コロナウイルス感染症によりリーグ戦の中断
8月 クラブ史上初のＪ１で3連勝を達成 |